СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ ВКЛАДА ПОЛИМОРФИЗМА ГЕНЕТИЧЕСКИХ МАРКЕРОВ В ФОРМИРОВАНИЕ ПАТОЛОГИЙ РАЗЛИЧНОГО ГЕНЕЗА (НА ПРИМЕРЕ АРТЕРИАЛЬНОЙ ГИПЕРТЕНЗИИ И ВИРУСНОГО ГЕПАТИТА С)
Аннотация
Цель исследования – анализ вклада полиморфизма генов IL-10, PPARGC1A, BCAT1 в формирование сердечно-сосудистой патологии (а именно артериальной гипертензии – АГ), а также полиморфизма гена IL-28B в формирование успешного ответа на интерферонотерапию при вирусном гепатите С с первым генотипом вируса. Оценка вклада генетических маркеров позволяет прогнозировать риск развития, особенности течения заболеваний, разрабатывать оптимальные терапевтические схемы.
Материалы и методы: Для оценки полиморфизма генов PPARGC1A, IL-10, BCAT1 сформированы две группы: экспериментальная (пациенты с АГ III степени) и контрольная (здоровые добровольцы без признаков сердечно-сосудистых нарушений). Для анализа влияния генетических маркеров SNP rs12979860 и rs8000917 гена IL-28B на эффективность интерферонотерапии выбраны две группы пациентов, инфицированных вирусом гепатита С 1 генотипа: ответившие и не ответившие на терапию. Материал для исследований – ДНК человека, выделенная из лейкоцитов периферической крови. Методы – полимеразная цепная реакция, рестрикционный анализ, секвенирование, высокоточный анализ кривых плавления.
Результаты: показана неоднозначная роль аллельных и генотипических вариантов локусов PPARGC1A, IL- 10, BCAT1 в формировании АГ 3 степени. Установлен значительный вклад изучаемых однонуклеотидных замен 39743165T>G (rs8099917) и 39738787C>T (rs12979860) гена IL-28B в формирование успешного ответа на интерферонотерапию при вирусном гепатите С с первым генотипом вируса (Fst=13,51% и Fst=8,63%, соответственно).
Литература
Даренская, М. А. Этнические и региональные аспекты патологических процессов у человека / М. А. Даренская // Бюллетень Восточно-Сибирского научного центра СО РАМН. – 2012. – № 2 (84). – С. 152-159.
Association of promoter region single nucleotide polymorphisms at positions -819C/T and -592C/A of interleukin 10 gene with ischemic heart disease / G.I. Yu [et al.] // Inflamm. Res. – 2012. – № 61(8). – P. 899-905.
Association of WNK1 gene polymorphisms and haplotypes with ambulatory blood pressure in the general population / M.D. Tobin [et al.] // Circulation. – 2005. – № 112(22). – P. 3423–3429.
Dominiczak, A.F. Genome-Wide Association Studies Will Unlock the Genetic Basis of Hypertension / A.F Dominiczak., P.B. Munroe // Hypertension. – 2010. – № 56. – P. 1017–1020.
Ehret, G.B. Genome-Wide Association Studies: Contribution of Genomics to Understanding Blood Pressure and Essential Hypertension / G.B. Ehret // Current Hypertension Reports. – 2010. – № 12(1). – P. 17–25.
European Population Genetic Substructure: Further Definition of Ancestry Informative Markers for Distinguishing among Diverse European Ethnic Groups / C. Tian [et al.] // Molecular Medicine. – 2009. – Vol.15, № 11-12. – P. 371–383.
Evidence for a gene influencing blood pressure on chromosome 17. Genome scan linkage results for longitudinal blood pressure phenotypes in subjects from the Framingham Heart Study/ D. Levy [et al.] // Hypertension. – 2000. – № 36(4). – P. 477–483.
Ge, D. Genetic variation in IL28B predicts hepatitis C treatment-induced viral clearance / D. Ge // Nature. – 2009. – № 461. – P. 399–401.
Genetic Structure of Human Populations / N.A. Rosenberg [et al.] // Science. – 2002. – Vol. 298, № 5602. – P.2381-2385.
Genetic Variation in IL28B Is Associated With Chronic Hepatitis C and Treatment Failure: A Genome-Wide Association Study / A. Rauch [et al.] // Gastroenterology. – 2010. – № 138. – P. 1338–1345.
Genome-wide association of IL28B with response to pegylated interferon-[alpha] and ribavirin therapy for chronic hepatitis C / Y. Tanaka [et al.] // Nat. Genet. – 2009. – № 41. – P. 1105–1109.
Heritability of blood pressure traits and the genetic contribution to blood pressure variance explained by four blood-pressure-related genes / M.J. van Rijn [et al.] // J. Hypertens. – 2007. – № 25(3). – P. 565–570.
Heritability of cardiovascular and personality traits in 6,148 Sardinians / G. Pilia [et al.] // PLoS Genetics. – 2006. – № 2(8). – P. 32.
Nei, M. Genetic distance between populations / M. Nei // American Naturalist. – 1972. – № 106. – P. 283–292.
Polymorphism in the IL10 promoter region and early markers of atherosclerosis: the Cardiovascular Risk in Young Finns Study/ M. Heiskanen [et al.] // Atherosclerosis. – 2010. – Vol. 208(1). – P.190-196.
Potential role for Interleukin-28B genotype in treatment decision-making in recent hepatitis C virus infection. ATAHC Study Group. / J. Grebely [et al.] // Hepatology. – 2010. – № 52. – P. 1216–1224.
PPARGC1A sequence variation and cardiovascular risk–factor levels: a study of the main genetic effects and gene x environment interactions in children from the European Youth Heart Study / E.C. Brito [et al.] // Diabetologia. – 2009. – Vol. 5, №4. – P. 609–613.
Replication of the Wellcome Trust genome-wide association study of essential hypertension: the Family Blood Pressure Program / G.B. Ehret [et al.] // Eur J Hum Genet. – 2008. – № 16(12). – P. 1507–1511.
Replication of the Wellcome Trust genome-wide association study on essential hypertension in a Korean population / K.W. Hong [et al.] // Hypertens Res. – 2009. – № 32(7). – P. 570-574.
The Gly482Ser genotype at the PPARGC1A gene and elevated blood pressure: a meta–analysis involving 13,949 individuals / K.S. Vimaleswaran [et al.] // JAppl Physiol. – 2008. – Vol.105. № 4. – P.1352–1358.
Utilizing New Tools to Define the Genetic Underpinnings of Risky Traits Associated with Coronary Artery Disease: The Sardinia Study / J.B. Strait [et al.] // Trends Cardiovasc. Med. – 2009. – № 19(3). – P. 69–75.
